MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 112404

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_003552	GAA	2	6	155634	155639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089028
3002	NC_003552	GAA	2	6	155658	155663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089028
3003	NC_003552	CCT	2	6	155671	155676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20089028
3004	NC_003552	A	6	6	155719	155724	100 %	0 %	0 %	0 %	20089028
3005	NC_003552	GAA	2	6	155809	155814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_003552	G	7	7	155847	155853	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_003552	AAATT	2	10	155890	155899	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_003552	TCACTT	2	12	155926	155937	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_003552	TTAT	2	8	155938	155945	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_003552	ACTCTT	2	12	155946	155957	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_003552	TAT	2	6	155979	155984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20089029
3012	NC_003552	GCG	2	6	156058	156063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	20089029
3013	NC_003552	ATC	2	6	156079	156084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089029
3014	NC_003552	GCCCAT	2	12	156090	156101	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	20089029
3015	NC_003552	CTT	2	6	156140	156145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089029
3016	NC_003552	TCC	2	6	156471	156476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20089029
3017	NC_003552	TCT	2	6	156487	156492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089029
3018	NC_003552	T	6	6	156492	156497	0 %	100 %	0 %	0 %	20089029
3019	NC_003552	CAGG	2	8	156507	156514	25 %	0 %	50 %	25 %	20089029
3020	NC_003552	TGA	2	6	156536	156541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20089029
3021	NC_003552	AGGG	2	8	156546	156553	25 %	0 %	75 %	0 %	20089029
3022	NC_003552	CAG	2	6	156603	156608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20089029
3023	NC_003552	GGC	2	6	156624	156629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	20089029
3024	NC_003552	AGG	2	6	156697	156702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20089029
3025	NC_003552	CGTC	2	8	156788	156795	0 %	25 %	25 %	50 %	20089029
3026	NC_003552	T	6	6	156914	156919	0 %	100 %	0 %	0 %	20089029
3027	NC_003552	CT	3	6	156974	156979	0 %	50 %	0 %	50 %	20089029
3028	NC_003552	T	7	7	157004	157010	0 %	100 %	0 %	0 %	20089029
3029	NC_003552	TTCCAT	2	12	157014	157025	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	20089030
3030	NC_003552	GCA	2	6	157061	157066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20089030
3031	NC_003552	CT	3	6	157078	157083	0 %	50 %	0 %	50 %	20089030
3032	NC_003552	CTGA	2	8	157117	157124	25 %	25 %	25 %	25 %	20089030
3033	NC_003552	ATA	3	9	157127	157135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20089030
3034	NC_003552	CA	3	6	157219	157224	50 %	0 %	0 %	50 %	20089030
3035	NC_003552	AG	3	6	157324	157329	50 %	0 %	50 %	0 %	20089030
3036	NC_003552	TAA	2	6	157446	157451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20089030
3037	NC_003552	TAC	2	6	157483	157488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089030
3038	NC_003552	GCA	2	6	157605	157610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20089030
3039	NC_003552	AG	3	6	157627	157632	50 %	0 %	50 %	0 %	20089030
3040	NC_003552	CTT	2	6	157716	157721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089030
3041	NC_003552	CTT	2	6	157787	157792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089030
3042	NC_003552	GGT	2	6	157798	157803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20089030
3043	NC_003552	GGGC	2	8	157910	157917	0 %	0 %	75 %	25 %	20089030
3044	NC_003552	TCC	2	6	157954	157959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20089030
3045	NC_003552	TC	4	8	158023	158030	0 %	50 %	0 %	50 %	20089030
3046	NC_003552	AGG	2	6	158034	158039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20089030
3047	NC_003552	GGA	2	6	158133	158138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20089030
3048	NC_003552	CTT	2	6	158139	158144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089030
3049	NC_003552	GTG	2	6	158185	158190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20089030
3050	NC_003552	TTTG	2	8	158191	158198	0 %	75 %	25 %	0 %	20089030
3051	NC_003552	TTG	2	6	158241	158246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20089030
3052	NC_003552	TAC	2	6	158302	158307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089030
3053	NC_003552	CTC	2	6	158323	158328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20089030
3054	NC_003552	T	8	8	158364	158371	0 %	100 %	0 %	0 %	20089030
3055	NC_003552	TCC	2	6	158389	158394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20089030
3056	NC_003552	T	6	6	158462	158467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_003552	AAT	2	6	158584	158589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_003552	AT	3	6	158681	158686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_003552	CCTGT	2	10	158700	158709	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3060	NC_003552	TAT	2	6	158727	158732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_003552	A	6	6	158781	158786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_003552	CTG	2	6	158788	158793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_003552	TCC	2	6	158822	158827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3064	NC_003552	AT	3	6	158839	158844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_003552	GCA	2	6	158950	158955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20089031
3066	NC_003552	GCAG	2	8	158966	158973	25 %	0 %	50 %	25 %	20089031
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3068	NC_003552	AGGG	2	8	159110	159117	25 %	0 %	75 %	0 %	20089031
3069	NC_003552	CTC	2	6	159118	159123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20089031
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3072	NC_003552	TTG	2	6	159331	159336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20089031
3073	NC_003552	GA	3	6	159393	159398	50 %	0 %	50 %	0 %	20089031
3074	NC_003552	GAT	2	6	159402	159407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20089031
3075	NC_003552	T	7	7	159435	159441	0 %	100 %	0 %	0 %	20089031
3076	NC_003552	TCTGGG	2	12	159532	159543	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	20089031
3077	NC_003552	ATC	2	6	159603	159608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089031
3078	NC_003552	GGAATC	2	12	159630	159641	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	20089031
3079	NC_003552	GAAG	2	8	159789	159796	50 %	0 %	50 %	0 %	20089031
3080	NC_003552	A	7	7	159804	159810	100 %	0 %	0 %	0 %	20089031
3081	NC_003552	ACC	2	6	159907	159912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	20089031
3082	NC_003552	TGA	2	6	160007	160012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20089031
3083	NC_003552	AAAAC	2	10	160203	160212	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3084	NC_003552	TCC	2	6	160281	160286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3085	NC_003552	ATTTT	2	10	160316	160325	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_003552	T	6	6	160330	160335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3088	NC_003552	AT	4	8	160371	160378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_003552	AT	3	6	160388	160393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_003552	AAATG	2	10	160446	160455	60 %	20 %	20 %	0 %	20089032
3091	NC_003552	AGA	2	6	160511	160516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089032
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3093	NC_003552	G	7	7	160569	160575	0 %	0 %	100 %	0 %	20089032
3094	NC_003552	GAA	2	6	160610	160615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089032
3095	NC_003552	GAC	2	6	160616	160621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20089032
3096	NC_003552	TAC	2	6	160633	160638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089032
3097	NC_003552	CAA	2	6	160654	160659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20089032
3098	NC_003552	AATC	2	8	160672	160679	50 %	25 %	0 %	25 %	20089032
3099	NC_003552	AGA	2	6	160684	160689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089032
3100	NC_003552	GAA	2	6	160736	160741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089032
3101	NC_003552	AGA	2	6	160890	160895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089032
3102	NC_003552	AAG	2	6	160952	160957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_003552	A	6	6	160974	160979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_003552	T	6	6	160998	161003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_003552	CATC	2	8	161038	161045	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3106	NC_003552	ATTT	2	8	161047	161054	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_003552	TTC	2	6	161100	161105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_003552	TTCA	2	8	161143	161150	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3109	NC_003552	GAA	2	6	161182	161187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_003552	TGTT	2	8	161193	161200	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_003552	T	6	6	161199	161204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_003552	CTT	2	6	161274	161279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089033
3113	NC_003552	CTT	2	6	161283	161288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089033
3114	NC_003552	TGC	2	6	161339	161344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20089033
3115	NC_003552	AAT	2	6	161361	161366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20089033
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3117	NC_003552	AGA	2	6	161435	161440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089033
3118	NC_003552	CTTG	2	8	161503	161510	0 %	50 %	25 %	25 %	20089033
3119	NC_003552	AAT	2	6	161512	161517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20089033
3120	NC_003552	T	6	6	161568	161573	0 %	100 %	0 %	0 %	20089033
3121	NC_003552	AAG	2	6	161680	161685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_003552	ATTA	2	8	161713	161720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_003552	TCA	2	6	161827	161832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_003552	TCA	2	6	161857	161862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_003552	CGC	2	6	161864	161869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3126	NC_003552	GGT	2	6	161885	161890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_003552	TTAT	2	8	161892	161899	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_003552	CTG	2	6	161914	161919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_003552	ATT	2	6	161923	161928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_003552	CCATA	2	10	162037	162046	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3131	NC_003552	TTG	2	6	162083	162088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_003552	GAC	2	6	162180	162185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20089034
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3134	NC_003552	CAT	2	6	162230	162235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089034
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3148	NC_003552	ATC	2	6	163118	163123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089035
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3155	NC_003552	TA	3	6	163482	163487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3157	NC_003552	TAC	2	6	163622	163627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3162	NC_003552	CT	3	6	163731	163736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3163	NC_003552	TAA	2	6	163746	163751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3164	NC_003552	TTCT	2	8	163802	163809	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3172	NC_003552	TA	3	6	164370	164375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3173	NC_003552	AAT	2	6	164398	164403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3175	NC_003552	A	6	6	164637	164642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3238	NC_003552	TCT	2	6	168469	168474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3239	NC_003552	TAT	2	6	168480	168485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3240	NC_003552	T	6	6	168504	168509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3241	NC_003552	TA	3	6	168525	168530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3242	NC_003552	TA	4	8	168567	168574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3243	NC_003552	CCACA	2	10	168772	168781	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
3244	NC_003552	A	6	6	168781	168786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3245	NC_003552	AAT	2	6	168805	168810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3246	NC_003552	GCA	2	6	168838	168843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3247	NC_003552	T	7	7	168876	168882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3248	NC_003552	A	6	6	168892	168897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3249	NC_003552	TGCC	2	8	168911	168918	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3250	NC_003552	ATTTT	2	10	168921	168930	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3251	NC_003552	CAGG	2	8	168931	168938	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3252	NC_003552	T	7	7	168957	168963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3253	NC_003552	AAAG	2	8	169023	169030	75 %	0 %	25 %	0 %	20089040
3254	NC_003552	GAA	2	6	169053	169058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089040
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3256	NC_003552	TTC	2	6	169098	169103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089040
3257	NC_003552	CCT	2	6	169226	169231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3258	NC_003552	GTA	2	6	169237	169242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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